多组学整合实践教程
本专栏规划多组学整合分析路线,目标是把转录组、表观组、蛋白质组和临床表型放在同一分析框架中解释。
实践路线
- 多组学项目设计与样本匹配
- 各组学数据预处理
- 特征选择和标准化
- 早期、中期、晚期整合策略
- 网络分析和模块识别
- 多组学因子分析
- 机器学习建模
- 生物学解释和报告
计划模块
- Module 01:实践数据集与样本配对
- Module 02:多组学矩阵整理
- Module 03:标准化和特征选择
- Module 04:相关性和网络分析
- Module 05:MOFA / mixOmics 入门
- Module 06:多组学聚类和分型
- Module 07:机器学习模型解释
- Module 08:整合分析报告模板
推荐前置知识
当前状态
本专栏为规划中内容。后续会优先补充小型公开数据集,保证示例能在普通电脑上复现。