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表观组学实践教程

本专栏规划表观组学数据分析教程，覆盖染色质可及性、蛋白-DNA 结合和 DNA 甲基化等方向。

实践路线​

  1. 数据集选择与实验类型识别
  2. FASTQ 质量控制
  3. 比对与去重复
  4. peak calling
  5. peak 注释与 motif 分析
  6. 差异 peak 分析
  7. 与转录组结果整合
  8. 结果可视化与报告

计划模块​

  • Module 01：实践数据集与实验设计
  • Module 02：ATAC-seq 标准分析流程
  • Module 03：ChIP-seq 标准分析流程
  • Module 04：peak calling 与质量评估
  • Module 05：peak 注释和 motif 富集
  • Module 06：差异开放区域分析
  • Module 07：甲基化数据分析入门
  • Module 08：表观组与转录组整合

推荐前置知识​

当前状态​

本专栏为规划中内容。单细胞方向的 scATAC-seq 内容会先在单细胞实践教程中完善。