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BioF3 Omics Tutorial

面向实践的生物组学数据分析教程

BioF3 将单细胞与多组学分析拆解成可阅读、可运行、可复现的学习单元, 帮助学习者从基础环境搭建走到完整分析流程。

当前重点课程scRNA-seq
数据获取质量控制降维聚类细胞注释功能解释
12单细胞实践模块
6组学实践专栏
5可下载完整脚本

Learning Path

按真实分析顺序组织课程

01

先建立分析环境

先确定测试数据、下载方式和本地目录,让后续每一步分析都有可复现输入。

02

再完成标准流程

围绕 Seurat 工作流学习质控、归一化、降维、聚类、注释和差异分析。

03

最后进入专题应用

继续学习数据整合、轨迹推断、细胞通讯、多模态、空间转录组和 scATAC-seq。

Core Modules

从这些模块开始动手

Omics Columns

按组学方向组织实践专栏

Reproducible Practice

教程、图示和完整脚本放在同一条学习线上

多个模块已经配套可下载 R 脚本和结果图,实践数据集页面提供 PBMC 3k、 CITE-seq、Visium 和 scATAC 的真实测试数据入口,适合边读教程边复现。 后续模块会继续按同一标准补齐实践材料。

查看实践数据集