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BioF3 Omics Tutorial

BioF3:把组学分析跑起来

BioF3 把生物组学分析拆成可阅读、可运行、可追溯的学习单元: 从环境、数据和脚本开始,一步步走到真实图表和结果解释。

当前重点课程scRNA-seq
数据获取质量控制降维聚类细胞注释功能解释
12单细胞实践模块
7主题专栏
5可下载完整脚本

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Learning Path

学习路线围绕一个目标:把分析真正跑通

01

建立分析底座

准备 R、Python、Bash、Notebook 和公开数据库检索能力,让后续分析有清楚输入。

02

跑通标准流程

围绕 scRNA-seq 学习原始处理、质控、归一化、降维、聚类、注释和差异分析。

03

进入专题应用

继续扩展到多样本整合、轨迹推断、细胞通讯、多模态、空间转录组和 scATAC-seq。

Core Modules

单细胞主线:从数据到解释

Omics Columns

先把一条主线做扎实,再扩展到多组学

Roadmap

内容建设进度

基础入门和单细胞专栏已全部上线,其余组学专栏的入门页已经可读,后续会按模块逐步补齐。下面是当前的完成度,透明可追溯。

  1. 基础入门已完成
    6/ 6
  2. 单细胞已完成
    12/ 12
  3. bulk RNA-seq持续更新
    1/ 8
  4. 基因组持续更新
    1/ 6
  5. 表观组持续更新
    1/ 6
  6. 蛋白质组持续更新
    1/ 5
  7. 多组学整合持续更新
    1/ 5

Reproducible Practice

每一节都尽量留下清楚的分析脚印

BioF3 的内容建设优先补齐数据入口、分析脚本、结果图、参数说明和 AI 辅助排错提示。 目标不是让读者只看懂流程,而是能在自己的电脑或服务器上重新跑出结果。

公开数据入口可下载脚本结果图示例参数和版本记录