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1. Binding Free Energies without Alchemy
📄 arXiv Paper | Date:
2026-03-12| Category:q-bio.QM
Authors: Michael Brocidiacono, Brandon Novy, Rishabh Dey et al.
AI Research Digest (科研解读)
一句话概括 本研究提出了一种无需炼金术中间态的隐式溶剂绝对结合自由能计算方法，通过预计算和复用受体与配体数据，显著降低了计算成本并提升了虚拟筛选效率。
研究背景
传统绝对结合自由能（ABFE）方法虽然预测精度高
2. A Multi-Label Temporal Convolutional Framework for Transcription Factor Binding Characterization
📄 arXiv Paper | Date:
2026-03-12| Category:q-bio.GN
Authors: Pietro Demurtas, Ferdinando Zanchetta, Giovanni Perini et al.
AI Research Digest (科研解读)
一句话概括 本文提出了一种基于时间卷积网络（TCN）的多标签深度学习框架，将转录因子结合位点识别从单一二元预测转变为多任务协同预测，以解析TF之间的结合相关性及协同调控机制。
研究背景
转录因子通常通过协同和合作机制调控基因表达，然而现有的结合位点预测方法多局限于单个因子的二元分类，未能充分解析不同转录因子之间复杂的相互作用和结合逻辑。
方法创新
该研究创新性地将转录因子结合识别构建为多标签分类任务，并引入时间卷积网络作为核心架构。TCN不仅能够高效处理序列数据的长期依赖关系，还能在多任务学习框架下捕捉不同转录因子结合事件之间的统计相关性和
3. High-throughput single-cell omics using semipermeable capsules.
📄 PubMed Article | Date:
2025 Dec 18| Category:Science (New York, N.Y.)
Authors: Baronas D, Norvaisis S, Zvirblyte J et al.
AI Research Digest (科研解读)
4. Taurochenodeoxycholic acid alleviates obesity-induced endothelial dysfunction.
📄 PubMed Article | Date:
2026 Mar 9| Category:European heart journal
Authors: Lu H, Wu Z, Wan M et al.
AI Research Digest (科研解读)
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